Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc1bQ920F6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1bQ920F6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1bQ920F6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms