Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms