Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca5Q91ZW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms