Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx18Q91ZR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms