Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdha12Q91Y18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms