Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Creb3l3Q91XE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Creb3l3Q91XE9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Creb3l3Q91XE9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms