Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pqbp1Q91VJ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pqbp1Q91VJ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pqbp1Q91VJ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms