Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrkQ8VDU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrkQ8VDU5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SnrkQ8VDU5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms