Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc9Q8VC31 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9Q8VC31 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms