Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc58Q8R3Q6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms