Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClmpQ8R373 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClmpQ8R373 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms