Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg10Q8R1P4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg10Q8R1P4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms