Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ltbp4Q8K4G1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ltbp4Q8K4G1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms