Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PolbQ8K409 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PolbQ8K409 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms