Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh16f2Q8K3M1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Rdh16f2Q8K3M1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Rdh16f2Q8K3M1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rdh16f2Q8K3M1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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