Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf13Q8K2W6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms