Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Paf1Q8K2T8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms