Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1728.2 ms