Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sde2Q8K1J5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms