Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem17Q8K0U3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem17Q8K0U3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms