Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 831.9 ms