Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klre1Q8CJC7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klre1Q8CJC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms