Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LgsnQ8CIX8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms