Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SbsnQ8CIT9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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SbsnQ8CIT9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SbsnQ8CIT9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SbsnQ8CIT9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SbsnQ8CIT9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SbsnQ8CIT9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SbsnQ8CIT9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SbsnQ8CIT9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms