Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cc2d2aQ8CFW7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cc2d2aQ8CFW7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cc2d2aQ8CFW7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms