Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm9955Q8CEJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm9955Q8CEJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9955Q8CEJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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