Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms