Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms