Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rsph6aQ8CDR2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph6aQ8CDR2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph6aQ8CDR2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms