Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc87Q8CDL9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms