Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ufl1Q8CCJ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ufl1Q8CCJ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ufl1Q8CCJ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms