Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf31Q8CCF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prpf31Q8CCF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf31Q8CCF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms