Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phtf2Q8CB19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phtf2Q8CB19 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phtf2Q8CB19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms