Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nhsl1Q8CAF4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nhsl1Q8CAF4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nhsl1Q8CAF4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nhsl1Q8CAF4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nhsl1Q8CAF4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nhsl1Q8CAF4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nhsl1Q8CAF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms