Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4aQ8C9S8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4aQ8C9S8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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