Protein–RNA interactions for Protein: Q8C754

Vps52, Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps52Q8C754 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps52Q8C754 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps52Q8C754 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps52Q8C754 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps52Q8C754 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps52Q8C754 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps52Q8C754 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms