Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6U3

Gm17334, Predicted gene, 17334, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17334Q8C6U3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17334Q8C6U3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17334Q8C6U3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm17334Q8C6U3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm17334Q8C6U3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17334Q8C6U3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17334Q8C6U3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17334Q8C6U3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17334Q8C6U3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17334Q8C6U3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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