Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp1Q8C4U3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfrp1Q8C4U3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms