Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssuh2Q8C3L1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms