Protein–RNA interactions for Protein: Q8C186

Bpifc, BPI fold-containing family C protein, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BpifcQ8C186 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BpifcQ8C186 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BpifcQ8C186 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BpifcQ8C186 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms