Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rapgef5Q8C0Q9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms