Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc169Q8BXX9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc169Q8BXX9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms