Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cldn17Q8BXA6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cldn17Q8BXA6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cldn17Q8BXA6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn17Q8BXA6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Cldn17Q8BXA6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn17Q8BXA6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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