Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TtpaQ8BWP5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TtpaQ8BWP5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms