Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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