Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig4Q8BTF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lig4Q8BTF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lig4Q8BTF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms