Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms