Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnrc6bQ8BKI2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms