Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fbxo28Q8BIG4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms