Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf41Q8BH75 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf41Q8BH75 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms